1) Синтетични транскрипция на конкретен ДНК молекула или фрагменти, направени от система за ин-витро транскрипция. Тази Черна може да бъде с радиоактивни урацил и след това се използва като сонда.

2) РНК за един stranded чиято базова последователност е допълнителна към конкретни ДНК секвенциите (напр, гени) или, по-рядко, друг един stranded РНК; обикновено грешно изкуствен хибридизацията сонда или антисенс генетични инхибитор.