Una forma de VNTR (q.v.). En concret, un segment d'ADN es caracteritza per l'ocurrència d'un nombre variable de còpies (des d'algun fins a 30 o una cosa així) d'una seqüència d'al voltant de 5 o menys bases (anomenat una unitat de repetició, q.v.). A microsatèl·lits típica és la unitat repetició AC, que es produeix en aproximadament 100 000 llocs diferents d'un genoma típiques dels mamífers. a qualsevol un lloc (locus), normalment hi ha diversos diferents "al·lels," cada identificables segons el nombre d'unitats de repetició. Aquests al·lels poden ser detectats per PCR (q.v.), utilitzant imprimacions ideat a partir de la seqüència única que es troba a banda i banda de la microsatèl·lits. PCR quan el producte s'executa en un gel electroforètica, al·lels són vistos a difereixen en longitud en unitats igual a la mida de la unitat de repetició, per exemple, si les imprimacions corresponen a la seqüència única immediatament a banda i banda de la microsatèl·lits cada 20 bases de llarg, i són un individu és humas per una AC microsatèl·lits amb un al·lèlica formada per 5 repeteix i repeteix l'altra formada per 6, el heterozigots exposarà dues bandes el gel, una banda que la 20 + (2 × 5) + 20 = 50 bases de llarg i les altre al·lèlica sent 20 + (2 × 6) + 20 = 52 bases llarg. Microsatèl·lits han estat el marcador d'ADN estàndard: són fàcilment detectables per PCR, i tendeixen a estar situats uniformement per tot el genoma. Milers han estat cartografiada amb moltes espècies diferents.