Une type II endonucléase de restriction qui lie (et par la suite s'attache) ADN à des sites qui contiennent une séquence de six paires de nucléotides qui est uniquement reconnue par cette enzyme. Parce que n'importe quelle séquence de six bases se produit moins fréquemment par hasard que n'importe quelle séquence de quatre bases, coupeurs de six-base s'attacher moins fréquemment que les coupeurs de quatre-base. Donc, coupeurs de six-base créer des fragments plus grands que la base de quatre couteaux.