Un plasmide capable de se répliquer dans deux organismes de différents hôtes, parce qu'il porte deux origines différentes, de réplication et peut donc servir à « navette » gènes de l'un à l'autre. Par exemple, le YEp, pJDB219, est un vecteur navette capable de se répliquer dans E. coli depuis son origine pMB9 et en Saccaromyces cerevisiae dès son origine de 2 µm-plasmide.