Le carbone organique qui forme la pompe biologique est transporté essentiellement par le naufrage des particules, par exemple des organismes morts (y compris les tapis d'algues) ou des boulettes fécales. Toutefois, certains tronçons de carbone l'océan profond comme le carbone organique dissous (COD) de transport physique processus tels que la plongée des eaux, plutôt que de sombrer. Pompe de de carbone.