Une technique qui identifie l'ADN cloné qui se chevauchent des fragments ce segment continu un formulaire d'un chromosome. Ces fragments peuvent être générés par tonte aléatoire ou par une digestion partielle avec un cutter quatre paires comme Sau 3 a. Une série de colonie est ensuite des hybridations, à partir de quelques fragments clonés qui a déjà été identifié et qui est connu pour être dans la région mise en valeur par les clones qui se chevauchent. Ce fragment identifié est utilisé comme une sonde de repérer les clones contenant des séquences adjacentes. Ceux-ci sont ensuite utilisés comme sondes elles-mêmes pour identifier des clones portant des séquences adjacentes à eux et ainsi de suite. à chaque tour d'hybridation un « marches » plus loin le long du chromosome chez le fragment initial.