Une molécule d'ADN double-brin ou hybride ADN-ARN, où chaque brin est d'une autre origine et par conséquent contenant un ou plus incompatibles des paires de bases (non complémentaires). A ADN duplex est préparé par l'hybridation des molécules d'ADN simple brin provenant de deux sources différentes. Où les deux ADN sont identiques, ou des séquences très similaires, une molécule bicaténaire seront établies, alors que lorsque les deux ADN diffèrent en séquence, régions monocaténaires restera. Un hétéroduplex se révélera comme simple-brin « buissons » lorsque l'ADN observe au microscope électronique. Une carte des régions homologues et non homologue des deux molécules peuvent ainsi être construits. Ce processus est appelé mappage hétéroduplex.