Une forme de VNTR (q.v.). Plus précisément, un segment d'ADN caractérisée par la survenue d'un nombre variable de copies (de quelques-uns jusqu'à 30 ou plus) d'une séquence de près de 5 ou moins de bases (appelé une unité de répétition, q.v.). A microsatellite typique est l'unité de répétition AC, qui se produit à environ 100 000 sites différents dans un génome de mammifères typique. Sur tout un site (locus), il y a généralement plusieurs « allèles différents, » chacune identifiables selon le nombre d'unités répétées. Ces allèles peuvent être détectés par PCR (q.v.), à l'aide d'amorces de la séquence unique qui se trouve de chaque côté du microsatellite. Lorsque des PCR le produit est exécuté sur un gel d'électrophorèse, allèles sont considérés diffèrent en longueur en unités égal à la taille de l'unité de répétition, par exemple, si les amorces correspondent à la séquence unique immédiatement de chaque côté du microsatellite et sont chacun 20 bases de temps, et un individu est hétérozygote pour un AC microsatellites avec un allèle comprenant 5 répétitions et l'autre comprenant 6 répétitions, l'hétérozygote exposera deux bandes sur le gel, une bande en 20 + (2 × 5) + 20 = 50 bases de long et l'autre allèle étant 20 + (2 × 6) + 20 = 52 bases longues. Microsatellites ont été le marqueur d'ADN standard : ils sont facilement détectables par PCR, et ils ont tendance à être uniformément situés dans tout le génome. Des milliers ont été cartographiées dans beaucoup d'espèces différentes.