Petrnamyslo omezení II typu, který váže (a následně štěpí) DNA na weby, které obsahují posloupnost čtyř párů nukleotidů, který je jednoznačně uznáván tento enzym. Protože libovolná posloupnost čtyř základen se vyskytuje častěji náhodou než libovolná posloupnost šesti základen, čtyři base řezačky štěpit častěji než šest base řezačky. Tedy, čtyři base řezačky vytvořit menší fragmenty než šest base řezačky.