Petrnamyslo omezení II typu, který váže (a následně štěpí) DNA na weby, které obsahují posloupnost šesti párů nukleotidů, které je jednoznačně uznáván tento enzym. Protože libovolná posloupnost šesti základny dochází méně často náhodou než libovolná posloupnost čtyř základen, šest base řezačky štěpit méně často, než čtyři base řezačky. Tedy, šest base řezačky vytvořit větší úlomky než čtyři base řezačky.