Postupy pro stanovení sekvence nukleotidů DNA fragment. Existují dvě běžné metody pro tento:

• Maxam a Gilbert technika (chemické degradace), který používá různé chemikálie rozbít DNA do fragmenty na konkrétní základny, nebo

• Sanger techniku (zvanou di-deoxy nebo ukončení řetězce metoda) používá DNA polymeráza vyrobit nové řetězce DNA, s di-deoxy nukleotidů (řetězec zakončení) zastavit řetěz, náhodně, jak roste.

V obou případech fragmentů DNA jsou odděleny podle délky dovezeni, umožňující sekvenční čtení přímo z gelu.