Polypeptid z rekombinantní gen, který obsahuje části dvou nebo více různých genů. Různé geny jsou spojeny tak, aby jejich genové sekvence jsou v stejném čtecí rámec: genetický aparát přečte gen syntézy jako jediného genu a tak vytváří syntézy bílkovin. Také známý jako hybridní protein nebo chimerických bílkovin. Se používají tyto proteiny:

-přidat značku afinitu k proteinu;

-na výrobu peptid jako součást většího proteinu, který je pak řez až poté, co byly provedeny pomocí klonování;

-produkovat protein s kombinovanou charakteristiky dvou přírodních bílkovin; nebo

- produkovat protein, kde jsou dvě různé činnosti fyzicky propojeny.