En aminosyresekvens, der har været udviklet til et protein til at lette sin rensning. Disse kan arbejde i en række forskellige måder. Tag kunne være et andet protein, der binder sig til nogle andre materiale meget stramt og dermed tillade proteinet skal renses af affinitet kromatografi (konflikten). Tag kunne være et kort aminosyresekvens, som er anerkendt af et antistof. Antistoffet ville derefter binder sig til proteinet der henviser til, at det ikke ville have gjort så før. , En af disse korte peptid, kaldet FLAG, er designet således at det er meget let at gøre antistoffer mod det. Tag kunne være et par aminosyrer, som derefter bruges som en kemisk tag på protein. For eksempel, en streng af positivt ladede aminosyrer binder meget stærkt til et negativt ladede filter: dette kunne bruges som grundlag for en adskillelse system. Nogle aminosyrer binde metaller kraftigt, især i par: kemiske slotsdistriktet kan udnyttes ved hjælp af et filter med metal atomer kemisk knyttet til det for at trække et protein ud af en blanding af proteiner.