En teknik, ved hjælp af enkelt, kort (normalt 10-mer) syntetiske oligonukleotid primere til PCR. Primer, hvis rækkefølge har valgt tilfældigt, indviede replikering på dets komplementære websteder på DNA, producerer fragmenter op til omkring 2 kb lang, hvilket kan være adskilt af elektroforese og farves med ethidiumbromid. En primer kan udstille polymorfi mellem individer, og polymorfe fragmenter kan bruges som markører.