Et plasmid i stand til at replikere i to forskellige værtsorganismer fordi det bærer to forskellige oprindelser af replikering og kan derfor bruges til at 'transport' gener fra den ene til den anden. For eksempel, YEp, pJDB219, er en shuttle vektor replicere i E. coli fra sin pMB9 oprindelse og i Saccaromyces cerevisiae fra oprindelsesstedet 2 µm-plasmid.