En type II begrænsning endonuklease, der binder (og efterfølgende kløver) DNA på websteder, der indeholder en sekvens af seks nukleotid par der anerkendes entydigt af dette enzym. Fordi enhver sekvens af seks baser sker mindre hyppigt af chance end en sekvens af fire baser, seks-base kuttere kløver mindre hyppigt end fire-base kuttere. Dermed, seks-base kuttere skabe større fragmenter end fire-base kuttere.