Der spezifische Nukleotidsequenz in DNA, die von einem Typ II Beschränkung Endonuclease und in denen es einen Doppelstrang-Schnitt macht erkannt wird. Einschränkung Websites umfassen in der Regel vier oder sechs Basenpaare, die in der Regel sind palindromische (q.v.), z. B. 5´GGCC3´

3´CCGG5´

die zwei Stränge können geschnitten werden entweder gegenüber einander, stumpfe enden, erstellen oder gestaffelt, endet die klebrige geben, abhängig von dem Enzym.