Ένα γονίδιο που είναι πιθανό να βρίσκονται στην ίδια περιοχή ως έναν δείκτη DNA που έχει αποδειχθεί να συνδεθούν σε ένα ενιαίος-locus γνώρισμα ή σε μια ποσοτική γνώρισμα locus (QTL), όπου του γονιδίου πιθανό θέση στο γονιδίωμα των εν λόγω ειδών βασίζεται σε τη γνωστή θέση στο χάρτη του ένα άλλο είδος, δηλαδή, είναι με βάση τον συγκριτικό χάρτη μεταξύ των δύο ειδών.