Μια αναλυτική μέθοδο για το διαχωρισμό των μορίων σύμφωνα με το μέγεθός τους. Δείγματα τίθενται στο ένα άκρο πλάκας ωτοπλαστική χωρίς όμως, ένα ηλεκτρικό πεδίο σε όλη τη γέλη τραβά τα μόρια μέσα από αυτό, τα μικρότερα μόρια περνούν πιο εύκολα και έτσι να προχωρήσουμε προς το άλλο άκρο πιο γρήγορα, τα διάφορα μεγέθη των μορίων που καταλήγουν σε διαφορετικές θέσεις, σύμφωνα με το μέγεθός τους. Τζελ είναι κατασκευασμένα από διαφορετικά υλικά.

Διάφορες χημικές ουσίες μπορούν να συμπεριληφθούν στο πήκτωμα να βοηθήσει διαχωρισμού, όπως το απορρυπαντικό dodecyl θειικό άλας νατρίου (SDS) σε πρωτεΐνη τζελ να ξεδιπλωθεί πρωτεΐνες, ή ουρία σε τζελ αλληλουχίας DNA, που ξεδιπλώνεται DNA.