Ένα σύστημα ταξινόμησης που δείχνει τα πλασμίδια που μπορούν να συνυπάρχουν σε ένα μεμονωμένο κελί. Πλασμίδια πρέπει να ανήκουν σε διαφορετικές ασυμβατότητα ομάδες να συνυπάρχουν μέσα στο ίδιο κελί. Πλασμίδια που ανήκουν στον ίδιο όμιλο ασυμβατότητα είναι ασταθής όταν τοποθετείται στο ίδιο κελί. Α πλασμίδιο κλωνοποίηση διάνυσμα πάντα πρέπει να ανήκουν σε μια ομάδα ασυμβατότητα που είναι διαφορετική από εκείνη του ενδογενή πλασμίδια το βακτήριο της υποδοχής.