Μια παραλλαγή ενός συγκεκριμένου ενζύμου. Σε γενικές γραμμές, όλα τα ισοένζυμα του ένα συγκεκριμένο ένζυμο έχουν την ίδια λειτουργία και μερικές φορές την ίδια δραστηριότητα, αλλά διαφέρουν σε αλληλουχία αμινοξέων. Με τη βοήθεια της ανάλυσης isozyme, βάσει ηλεκτροφόρηση τεχνικές που μπορούν να χωρίσουν τις διαφορετικές παραλλαγές, συγγενικά είδη ή ποικιλίες μπορούν να διακριθούν.