1. Ρήμα: για τον προσδιορισμό της σχετικής θέσεως των loci σε ένα μόριο DNA. Σύνδεση χαρτογράφηση γίνεται με τον υπολογισμό του κλάσματος ανασυνδυασμού μεταξύ loci, από το γονότυπων της απογόνους του συγκεκριμένου συζεύξεις. Περαιτέρω χώρια δύο loci είναι σε χρωμόσωμα, η μεγαλύτερη θα είναι η συχνότητα του ανασυνδυασμού μεταξύ τους έως και 50%, η κατάσταση που παρατηρήθηκε όταν είναι τόσο επαρκώς μακριά σε χρωμόσωμα ότι ανασυνδυασμένο γαμέτες είναι τόσο συχνές ως μη-ανασυνδυασμένου γαμετών, ή όταν είναι στο διαφορετικών χρωμοσωμάτων. Φυσική χαρτογράφηση συνήθως γίνεται με τη χρήση του σε situ υβριδισμού των κλωνοποιημένων τεμαχίων DNA να χρωμοσωμάτων μετάφασης.

2. Ουσιαστικό: ένα διάγραμμα που δείχνει τις σχετικές θέσεις του, και τις αποστάσεις μεταξύ, loci.