Μια διαδικασία που χρησιμοποιείται για το διαχωρισμό πολύ μεγάλα μόρια DNA από εναλάσσοντας την κατεύθυνση του ηλεκτρικού ρεύματος κατά τρόπον παλμικού σε όλη ένα ημιστερεά gel.