Una técnica que identifica ADN superpuesto clonado fragmentos de ese segmento continuo una forma de un cromosoma. Estos fragmentos pueden generarse por corte al azar o por digestión parcial con un cortador de cuatro pares como Sau 3A. Una serie de Colonia hibridaciones realizada seguidamente, a partir de algún fragmento clonado que ya ha sido identificado y que se conoce en la región que abarcaba los clones superpuestos. Este fragmento identificado se utiliza como una sonda para escoger los clones que contiene secuencias adyacentes. Entonces se utilizan como sondas de sí mismos para identificar clones llevan secuencias adyacentes a ellas y así sucesivamente. En cada ronda de hibridación uno "paseos" más a lo largo del cromosoma del fragmento inicial.