Una secuencia de ADN encontrada en varios genes que participan en la especificación de los órganos en partes del cuerpo diferentes en los animales; son característicos de los genes que influyen en la segmentación en los animales. La caja homeo corresponde a una secuencia de aminoácidos en el polipéptido codificada por estos genes; esta secuencia se llama el homeodomain.