Un esquema de clasificación que indica que los plásmidos pueden coexistir dentro de una sola célula. Plásmidos debe pertenecer a grupos diferentes de incompatibilidad a coexistir dentro de la misma célula. Plásmidos que pertenecen al mismo grupo de incompatibilidad son inestables cuando se coloca en la misma celda. A plásmido vector de clonación deben siempre pertenece a un grupo de incompatibilidad distinto de plásmidos endógena de la bacteria huésped.