Un polipéptido de un gen recombinante que contiene porciones de dos o más genes diferentes. Los diferentes genes se unen para que sus secuencias de codificación están en el mismo marco de lectura: el aparato genético Lee la fusión del gene como un solo gen y así produce una proteína de fusión. También conocida como proteína híbrida o proteína quimérica. Estas proteínas se utilizan:

-para agregar una etiqueta de afinidad a una proteína;

-para producir un péptido como parte de una proteína más grande, que luego se cortó después de que se ha realizado mediante la clonación;

-para producir una proteína con las características combinadas de dos proteínas naturales; o

- para producir una proteína donde están vinculadas físicamente dos actividades diferentes.