Vahel vastavalt nende suurusele molekulide analüüsimeetodit. Proovi panna plaat polümeeri geel ühes otsas elektrivälja kogu geeli tõmbab läbi molekulide väiksemad molekulid läbima kergemini ja nii liikuma teises otsas kiiremini; molekulid erineva suurusega lõpuks on erinevaid positsioone vastavalt nende suurusele. Geelid on valmistatud erinevatest materjalidest.

Erinevate kemikaalide võib kanda geel aitab eraldamine, nagu esitatud detergentide naatriumdodetsüülsulfaati (SDS) ja valgu geelid paljastama valkude või DNA järjestuse geelid, uurea mida tuttavat DNA.