Väike klaasist pind mis on fikseeritud hulgaliselt DNA killud, igaühel on määratletud koht. A tüüpiline DNA kiip sisaldaks 10 000 diskreetse laigud (igaüks sisaldab erinevat DNA fragmenti) vaid mõne trükkplaadi pindala. Kui fluorescently märgistatud DNA lahus killud on hybridized kiip, hübridisatsioon esineb laigud muutuvad nähtavaks kui fluorestsentsi. Kui kiip laik on geenid (väljendatud jada tags viise), hübridisatsioon cDNA konkreetsete kudede näitab, millised geenid on väljendatud kõnealuses koes. Kui laigud on lühikesed, sünteesitud oligonucleotides (ligikaudu 25 alused) vastav osa, geen, mis sisaldab ühe nukleotiidi polümorfism (SNP)(q.v.), kus eraldi koht kõigi 4 võimalik alus selle, hübridisatsioon genoomse DNA üksikute taimede või loomade lubab, et üksikute kelle genotüüpi kell nii palju SNP loci nagu on esindatud kiibil. DNA kiipide suur eelis on kuhu genotüübi määramise protsessi automatiseerida, võimaldades suurest hulgast taimi või loomi kelle genotüüpi tohutu arvu lookuste ulatuses.