Termin, millega kirjeldatakse protsessi või ensüümi, mis toimib määratletud numbriseeria jooksul DNA või RNA molekuli. II tüüpi piirangut ensüümid on kohaspetsiifiline endonucleases ja kodeeritud mõned transponsoone on kohaspetsiifiline nagu rekombinatsioon on phage võtta integratsiooni ning E. coli kromosoomi.