A tüüp II restriktaasi mis seob (ja hiljem lõhustab) DNA saidid, mis sisaldavad kuus nukleotiidi paari jada, mis on üheselt tunnustatud ensüümi. Sest kuus alustel jadale esineb harvem juhus kui neli alused jadale, kuue-base Freesid lõhustumisel harvem kui teha neli-base Freesid. Seega, kuue-base Freesid luua suurem killud kui nelja-base Freesid.