Jäteveden käsittely on yleisin bioteknologisilla menetelmillä länsimaissa käsitellä ihmisten ja eläinten jätteet, että tällaiset yhteiskunnat tuottaa valtavia määriä. Jäteveden hoitomenetelmät vaihtelevat suuresti, mutta kaikilla on biologisesti hajottaa jäteveden orgaaninen aines ja muuttaa sen joksikin, joka voidaan turvallisesti laskea ympäristöön (yleensä jokien tai meren).