Orgaanisen hiilen, joka muodostaa biologisten pumpun on kuljettaa ensisijaisesti uppoaminen hiukkasten materiaali, esimerkiksi kuolleiden eliöiden (mukaan lukien levien matot) tai fekaalisten pelletit. Kuitenkin joitakin hiilen saavuttaa liuennut orgaaninen hiili (DOC) fyysinen liikennevälineillä kuin syvä valtameren käsittelee esimerkiksi downwelling sen sijaan, että uppoaminen. Carbon pumppu.