Ajout d'une enzyme de restriction à un ADN échantillon dans des conditions particulières ou pour une période limitée, telle que seule une proportion des sites cibles dans n'importe quelle molécule individuelle sont clivés. Partielle digestions sont souvent effectuées pour donner une collection qui se chevauchent de fragments d'ADN devant servir à la construction d'une banque de gènes.