La proportion des gamètes qui sont apparues de recombinaison entre deux loci. On estime que le nombre d'individus recombinants parmi un jeu de descendants d'un accouplement particulier, divisé par le nombre total de descendants de cet accouplement. Représenté par la lettre grecque thêta (). Assemblage cartes sont créées à partir des estimations de la fraction de recombinaison entre toutes les combinaisons par paires de loci.