Le passage d'une molécule d'ADN qui est réplicable à partir d'une seule origine. Plasmides et chromosomes de bactérie, de phages et d'autres virus ont généralement une seule origine de réplication et, dans ces cas, la molécule d'ADN ensemble constitue un réplicon unique. Eucaryotique chromosomes ont de multiples origines internes et donc contenant plusieurs réplicons. Le mot est souvent utilisé dans le sens d'une molécule d'ADN capable de réplication autonome, par exemple, « le pJDB219 de vecteur navette est un réplicon dans les deux levures et E. coli. »