Une enzyme qui digère l'ADN ou ARN, en commençant à l'extrémité des brins. Requiere une extrémité libre pour dégrader une molécule d'ADN ou d'ARN. 5´ exonucleases nécessitent une extrémité libre 5´ et dégrader la molécule dans la 5´ de direction 3´. 3´ exonucleases nécessitent une extrémité libre 3´ et dégrader la molécule dans la direction opposée.