Une méthode pour séparer les acides nucléiques ou des molécules de protéines selon leur poids moléculaire. Les molécules migrent à travers la matrice du gel inerte sous l'influence d'un champ électrique. Dans le cas de la protéine PAGE, détergents tels que dodécylsulfate de sodium (SDS) sont souvent ajoutés pour s'assurer que toutes les molécules ont une charge uniforme. Secondary structure peut souvent entraîner la migration anormale des molécules. C'est pourquoi il est courant de dénaturer les échantillons de protéines en les faisant bouillir avant PAGE. Dans le cas des acides nucléiques, dénaturation des agents tels que l'hydroxyde mercurique de formamide, d'urée ou méthyl sont souvent incorporé dans le gel lui-même, qui peut également être exécuté à haute température. PAGE est utilisé pour séparer les produits de réactions de séquençage de l'ADN et les gels utilisés sont hautement dénaturation, puisque les molécules différant en taille par un seul nucléotide doivent être résolus.