Egy enzim, amely kifejezetten rontja az RNS vagy egyes szálú DNS 5´ mononucleotides. Tisztított-ból a fonalas gomba Aspergillus oryzae, S ₁ nukleáz használják értékelése a hibridizáció reakció mértéke lappal régiók eltávolításával. Azt is használják, hogy távolítsa el a ragadós vége restrikciós fragmentumok . -S ₁ feltérképezése, a kódoló régióban gén teljesítő mRNS-DNS hibridizációs és eltávolításával lappal DNS-val S ₁ nukleáz érzékel.