Bakteriális, gombás vagy alga mikroorganizmus véletlenül be a kultúra vagy a táptalaj. Szennyezőanyag nagyobbra nő a növényi sejtekben, és következésképpen akadályozzák a növekedésüket. Működő aszeptikus körülmények között a potenciális szennyező anyagok szigorú kizárása kell gyakorolják a növényi szövettenyésztés.