Egy nukleotid-szekvenciájának - 4, 6 vagy 8 nukleotidok - általában álló, elismert, és amely egy korlátozás endonukleázok (restrikciós enzim) kötődik, hogy. Típus II restrikciós enzim (azok a gén-klónozás kísérletekben felhasznált) egyben a sorozat, amelyen belül az enzim kifejezetten darabok (és a megfelelő enzimek metiláljunk) a DNS-t, azaz a típus II enzimek, a felismerés az oldal és a célterületre is ugyanabban a sorrendben. Típusú enzimek kötődik a felismerés az oldal, és majd Ragaszkodjatok a DNS-ben, néhány többé-kevésbé véletlen munkahelyen kívül a felismerés az oldal.