Egy osztály az enzimeknek DNS vagy RNS molekulák a cleaving az foszfo-diészter kötvények, hogy a szomszédos nukleotidok link. Lehet a nyálkát lebontó (Dnáz), a szubsztrát a DNS-t. a endonukleázok, valamin a szubsztrát molekulában belső oldalak. Exonuclease fokozatosan hasítja a szubsztrát molekulák végétől. Ribonukleáz (RNáz), a hordozó az RNS. , S1 nukleáz, az aljzat az egyetlen szálú DNS vagy RNS. Nucleases is különböző fokú bázis-sorrendjét sajátosságait, a különleges, hogy a korlátozás endonucleases.