A nukleinsav vagy fehérje molekulák, molekuláris méretük szerint elválasztó módszer. a molekulák vándorolnak az inert gél mátrix elektromos mező hatására. Abban az esetben, protein oldal, tisztítószerek, mint a nátrium-dodecil szulfát (SDS) gyakran egészül ki annak érdekében, hogy minden molekulák egy egységes díjat. Másodlagos szerkezetének molekulák rendellenes vándorlása gyakran vezethet. Ezért gyakori, hogy a denaturálásra fehérje minták forralással, mielőtt oldal . Abban az esetben, nukleinsavak, denaturálószer, mint például a formamid, urea vagy metil-higany hidroxid gyakran be vannak építve a gél, maga, amelyet magas hőmérsékleten is futtatható. Oldal használt DNS-szekvenálás reakciók a termékek elkülönítésére és alkalmazott gélek rendkívül denaturálás, mivel eltérő méretű által egyetlen nukleotid molekulák kell megoldani.