A hossza, a DNS változása előfordulásának töredékek, amelyek előállítása után, a type II korlátozás endonukleázok bontási. a különbség a DNS hosszban, a jelenlét vagy a felismerés hely(ek) számára az adott restrikciós enzim hiánya. RFLPs eredetileg talált DNS-próbákkal után szétválasztása megemésztett genomikus DNS hibridizáció használja gél-elektroforézis segítségével (déli elemzés). , Most ők általában kimutatható elektroforézis megemésztett PCR termék.