Egy sor három nulecotides, amelyek esetében nem megfelelő génnel molekula beszúrásához egy aminosav polipeptid láncba. a fehérje szintézis ezért megszűnik, és a kitöltött polipeptid szabadul fel a riboszóma. Három stop kodon találhatók: UAA (ochre), UAG (sárga) és UGA (opál). Mutációk, amelyek akármi-ból ezek három Kodonjai abban a helyzetben, amely általában tartalmaz egy kodon megadása egy aminosav úgynevezett nonszensz mutációt. Stop kodon is nevezik kodon nonszensz.