Enzim yang khusus mendegradasi RNA atau DNA beruntai tunggal untuk 5´ mononucleotides. Dimurnikan dari jamur berserabut Aspergillus oryzae, S ₁ nuclease digunakan dalam menilai sejauh mana reaksi hibridisasi dengan menghapus berelektron daerah. Hal ini juga digunakan untuk menghapus ujung yang lengket pembatasan fragmen. Di S ₁ pemetaan, daerah pengkode gen terdeteksi oleh melakukan hibridisasi mRNA DNA dan menghapus berelektron DNA dengan S ₁ nuclease.