Metode analisis untuk memisahkan molekul menurut ukuran mereka. Sampel diletakkan pada salah satu ujung lempengan polimer gel; medan listrik di gel menarik molekul melalui molekul kecil melewati lebih mudah dan begitu bergerak menuju ujung lain lebih cepat; berbagai ukuran molekul berakhir pada posisi yang berbeda menurut ukuran mereka. Gel yang terbuat dari bahan yang berbeda.

Berbagai bahan kimia dapat dimasukkan dalam gel untuk membantu pemisahan, seperti deterjen natrium lauryl sulfat (SDS) dalam protein gel terungkap protein, atau urea dalam DNA sequencing gel, yang terungkap DNA.