Metode kloning urutan pengkodean gen, dimulai dengan yang mRNA transkripsi. Hal ini biasanya digunakan untuk mengkloning salinan DNA dari mRNA eukariotik lainnya. Salinan cDNA, menjadi salinan molekul messenger matang, tidak akan berisi urutan intron apapun dan dapat mudah dinyatakan dalam organisme tuan rumah jika melekat cocok promotor urutan dalam vektor kloning.