Metode untuk memisahkan asam nukleat atau molekul protein menurut ukuran molekul mereka. Molekul bermigrasi melalui matriks inert gel di bawah pengaruh medan listrik. Dalam kasus protein halaman, deterjen seperti natrium lauryl sulfat (SDS) sering ditambahkan untuk memastikan bahwa semua molekul memiliki muatan seragam. Struktur menengah dapat sering mengakibatkan migrasi anomali molekul. Karena itu umum untuk mengubah sifat sesuatu benda protein sampel dengan merebus mereka sebelum halaman. Dalam kasus asam nukleat, denaturing agen seperti formamide, urea atau metil mercuric hidroksida sering dimasukkan ke dalam gel sendiri, yang juga dapat dijalankan pada suhu tinggi. Halaman yang digunakan untuk memisahkan produk reaksi Sekuensing DNA dan gel bekerja sangat denaturing, karena molekul-molekul yang berbeda dalam ukuran oleh sebuah nukleotida tunggal harus diselesaikan.