Sebuah istilah yang digunakan untuk menggambarkan setiap proses atau enzim yang bertindak pada urutan didefinisikan dalam molekul DNA atau RNA. Tipe II pembatasan enzim spesifik lokasi endonucleases dan rekombinasi yang dikodekan oleh transposon beberapa sistem spesifik lokasi, seperti integrasi FAG ke E. coli kromosom.